Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM233B4DJY2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms