Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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LINC00587B1AMM8 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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LINC00587B1AMM8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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LINC00587B1AMM8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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LINC00587B1AMM8 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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LINC00587B1AMM8 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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LINC00587B1AMM8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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LINC00587B1AMM8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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LINC00587B1AMM8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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LINC00587B1AMM8 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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