Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEMP2A6NFY4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms