Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms