Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms