Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms