Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REREQ9P2R6 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
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