Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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MIS18AQ9NYP9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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MIS18AQ9NYP9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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MIS18AQ9NYP9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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