Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL11Q9NVR0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms