Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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