Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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