Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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