Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TMEM208Q9BTX3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms