Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms