Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTP4Q96DX8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms