Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms