Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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