Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms