Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms