Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6P435 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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