Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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