Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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