Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms