Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms