Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
COBLL1Q53SF7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms