Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAL1Q4LDG9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL1Q4LDG9 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms