Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms