Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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RPE65Q16518 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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RPE65Q16518 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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RPE65Q16518 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPE65Q16518 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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