Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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