Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST6Q15828 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST6Q15828 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST6Q15828 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST6Q15828 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CST6Q15828 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST6Q15828 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST6Q15828 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST6Q15828 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST6Q15828 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms