Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NPTX1Q15818 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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