Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED1Q15648 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED1Q15648 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED1Q15648 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED1Q15648 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED1Q15648 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MED1Q15648 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED1Q15648 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED1Q15648 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MED1Q15648 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED1Q15648 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED1Q15648 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED1Q15648 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED1Q15648 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED1Q15648 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED1Q15648 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED1Q15648 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED1Q15648 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED1Q15648 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED1Q15648 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED1Q15648 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED1Q15648 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED1Q15648 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED1Q15648 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms