Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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