Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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