Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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