Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
APOFQ13790 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
APOFQ13790 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms