Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA3CQ13748 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms