Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms