Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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