Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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