Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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