Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME3Q13232 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME3Q13232 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME3Q13232 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME3Q13232 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME3Q13232 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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