Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACACAQ13085 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACACAQ13085 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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