Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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GRIK2Q13002 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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