Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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AP1B1Q10567 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms