Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6H9

TMEM62, Transmembrane protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM62Q0P6H9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM62Q0P6H9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms