Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms