Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR1Q08345 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms