Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms