Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms